La modificación que debe hacer es la siguiente:
tmpdir = /directorio/usted/quiera
Luego enviar el comando de RESTART del servicio MySQL
service mysql restart
Nota: No olvide asignar los permisos al /directorio/usted/quiera para el usuario de mysql
Puede asignar permisos con el siguiente comando por SSH:
<-// EJEMPLO
chown mysql:mysql /newdir
chown mysql:mysql /newdir/mysql//-> FIN
Debe asegurarse el directorio tenga permisos de escritura.
Para hacer